MALDI-TOF MS analizinde en sık karşılaşılan sorulardan biri, skor değerlerinin ne anlama geldiğidir. Bruker MALDI Biotyper sistemi, her tanımlama için bir log skor değeri üretir. Bu makalede skor değerlerinin nasıl yorumlanacağını ve güvenilirlik kriterlerini detaylıca açıklıyoruz.
Skor Değeri Nedir?
Bruker MALDI Biotyper, elde edilen spektrumu veritabanındaki referans spektrumlarla karşılaştırır ve bir log skor değeri (0-3 arası) üretir. Bu değer, bilinmeyen spektrum ile en iyi eşleşen referans spektrum arasındaki benzerliği ifade eder. Yüksek skor, yüksek güven anlamına gelir.
Skor Aralıkları ve Yorumlama
| Skor | Renk | Tanımlama Seviyesi | Güven |
|---|---|---|---|
| 2.300 - 3.000 | Yeşil (A) | Tür (high confidence) | Çok Yüksek |
| 2.000 - 2.299 | Yeşil (B) | Tür (secure) | Yüksek |
| 1.700 - 1.999 | Sarı | Cins (genus) | Orta |
| 0.000 - 1.699 | Kırmızı | Güvenilir değil | Düşük |
Düşük Skor Nedenleri
- Eski kültür: 72 saatten eski kültürlerde protein profili bozulur
- Karışık koloni: İki türün karışması düşük skor üretir
- Yanlış besiyeri: Selektif agar artıkları matriks girişimi yapar
- Yetersiz hücre: Çok küçük koloni zayıf spektrum verir
- Veritabanı eksikliği: Tür veritabanında yoksa skor düşük olur
- Matriks kalitesi: Eski/bozuk matriks çözeltisi
Ne Yapmalı?
- Skor 1.7-1.999: Cins tanımlaması güvenilir. Tür için taze subkültür yapıp tekrar deneyin.
- Skor < 1.7: Formik asit ekstraksiyonu deneyin. Hala düşükse, 16S rRNA sekanslama önerilir.
- Skor ≥ 2.0: Güvenilir tür tanımlaması. Ek doğrulamaya gerek yok.
Best 10 Match Listesi
Biotyper yazılımı, en iyi 10 eşleşmeyi listeler. İlk 3 sonucun aynı tür olması, tanımlamanın güvenilirliğini artırır. İlk sonuç farklı türse, dikkatli olunmalıdır.
Sonuç
Skor değerlerini doğru yorumlamak, MALDI-TOF sonuçlarının güvenilir kullanımı için kritiktir. SSS sayfamızda daha fazla bilgi bulabilirsiniz.
MALDI-TOF Hizmetimiz Hakkında Bilgi Alın
Numune göndermek, fiyat teklifi almak veya hizmetlerimiz hakkında soru sormak için bizimle iletişime geçin.