Maya ve küf (filamentöz fungus) tanımlaması, bakteri tanımlamasına göre geleneksel olarak daha zor ve uzun sürelidir. MALDI-TOF MS, bu alanda da devrim yaratmış ve真菌 tanımlamasını dakikalara indirmiştir. Bu makalede, MALDI-TOF ile maya ve küf tanımlamasının nasıl yapıldığını inceleyeceğiz.
Maya Tanımlamasında Zorluklar
Mayaların geleneksel tanımlaması, morfolojik ve fizyolojik özelliklere dayanır:
- Germ tüp testi: C. albicans için (4 saat, sadece C. albicans pozitif)
- Kromojenik agar: C. albicans (yeşil), C. tropicalis (mavi), C. krusei (pembe)
- Karbonhidrat asimilasyon: API 20C AUX (24-48 saat)
- Mikroskopi: Pseudohif, hif, blastokonidyum oluşumu
Bu yöntemler özellikle nadir Cryptococcus, Rhodotorula, Trichosporon türlerinde yetersiz kalır. MALDI-TOF MS tüm klinik maya türlerini dakikalar içinde tanımlar.
Küf Tanımlamasında Zorluklar
Filamentöz fungusların tanımlaması daha da zordur:
- Sporulasyon gerekli: Çoğu küf, üremeden önce spor oluşturmalıdır (5-14 gün)
- Morfolojik değerlendirme: Konidyum şekli, renk, dizilim
- DNA sekanslama: ITS veya β-tubulin gen bölgeleri
MALDI-TOF MS ile küf tanımlaması için, ekstraksiyon protokolü (formik asit) uygulanır ve genç kültürden (48-72 saat) alınan mycelium kullanılır.
MALDI-TOF ile Maya Tanımlama Protokolü
- Saboraud Dekstroz Agar'dan taze koloni al
- Doğrudan yayma veya formik asit ekstraksiyonu
- Matriks (CHCA) uygula
- Cihazda spektrum al
- Veritabanı ile eşleştir
Klinik Önemi Olan Maya Türleri
| Tür | Klinik Önemi |
|---|---|
| Candida albicans | En yaygın fungal patojen |
| Candida auris | Çok ilaca dirençli, salgın potansiyeli |
| Candida glabrata | Azol direnci yaygın |
| Cryptococcus neoformans | Menenjit (immünsüprese) |
| Rhodotorula mucilaginosa | Fungemi (kateter) |
Endüstriyel Önemi Olan Küfler
- Aspergillus niger: Gıda/kozmetik kontaminasyonu
- Aspergillus flavus: Aflatoksin üretimi (gıda güvenliği)
- Penicillium spp.: Gıda bozulması, peynir üretimi (starter)
- Fusarium spp.: Bitki patojeni, mikotoksin
Candida auris Özel Durumu
C. auris, son yıllarda küresel bir tehdit haline gelmiş, çok ilaca dirençli bir mayadır. MALDI-TOF MS, C. auris'i güvenle tanımlayabilir, ancak bazı eski veritabanı sürümlerinde C. haemulonii ile karışabilir. Güncel BDAL veritabanı bu sorunu çözmüştür.
Sonuç
MALDI-TOF MS, maya ve küf tanımlamasında geleneksel yöntemlere göre çok daha hızlı ve doğru sonuçlar sağlar. Hizmetlerimiz hakkında bilgi alın veya iletişime geçin.
MALDI-TOF Hizmetimiz Hakkında Bilgi Alın
Numune göndermek, fiyat teklifi almak veya hizmetlerimiz hakkında soru sormak için bizimle iletişime geçin.